MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p2

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017023	GAAAAA	2	12	3	14	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383315347
2	NC_017023	A	7	7	44	50	100 %	0 %	0 %	0 %	383315347
3	NC_017023	TCAT	2	8	130	137	25 %	50 %	0 %	25 %	383315347
4	NC_017023	GAA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315347
5	NC_017023	ATG	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315347
6	NC_017023	AT	3	6	297	302	50 %	50 %	0 %	0 %	383315347
7	NC_017023	CAC	2	6	315	320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315347
8	NC_017023	GAA	2	6	349	354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315347
9	NC_017023	CAA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315347
10	NC_017023	TCAA	2	8	412	419	50 %	25 %	0 %	25 %	383315347
11	NC_017023	ACA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315347
12	NC_017023	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	383315347
13	NC_017023	TAAA	2	8	500	507	75 %	25 %	0 %	0 %	383315347
14	NC_017023	ATT	2	6	527	532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315347
15	NC_017023	CAA	2	6	649	654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315347
16	NC_017023	GTC	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315347
17	NC_017023	TGA	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315347
18	NC_017023	A	6	6	796	801	100 %	0 %	0 %	0 %	383315347
19	NC_017023	A	6	6	832	837	100 %	0 %	0 %	0 %	383315347
20	NC_017023	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315347
21	NC_017023	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315347
22	NC_017023	AGG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315347
23	NC_017023	TGA	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315347
24	NC_017023	TAATTG	2	12	1009	1020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383315348
25	NC_017023	ATG	2	6	1049	1054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315348
26	NC_017023	TCG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315348
27	NC_017023	TGA	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315348
28	NC_017023	TTAT	2	8	1228	1235	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017023	AAG	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315349
30	NC_017023	A	6	6	1314	1319	100 %	0 %	0 %	0 %	383315349
31	NC_017023	GATT	2	8	1351	1358	25 %	50 %	25 %	0 %	383315349
32	NC_017023	TCG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315349
33	NC_017023	TGA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315349
34	NC_017023	TGAG	2	8	1582	1589	25 %	25 %	50 %	0 %	383315349
35	NC_017023	ATT	2	6	1635	1640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017023	T	6	6	1699	1704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017023	TTA	2	6	1822	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017023	AGG	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017023	ATA	2	6	1906	1911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315350
40	NC_017023	A	6	6	1933	1938	100 %	0 %	0 %	0 %	383315350
41	NC_017023	AAAT	2	8	1999	2006	75 %	25 %	0 %	0 %	383315350
42	NC_017023	GAA	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
43	NC_017023	A	7	7	2118	2124	100 %	0 %	0 %	0 %	383315350
44	NC_017023	TGA	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315350
45	NC_017023	TAC	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315350
46	NC_017023	TGA	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315350
47	NC_017023	TTC	2	6	2195	2200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315350
48	NC_017023	AAC	2	6	2215	2220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315350
49	NC_017023	CAA	2	6	2246	2251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315350
50	NC_017023	AAGT	2	8	2332	2339	50 %	25 %	25 %	0 %	383315350
51	NC_017023	CAG	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315350
52	NC_017023	AAT	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315350
53	NC_017023	TTGG	2	8	2524	2531	0 %	50 %	50 %	0 %	383315350
54	NC_017023	TGA	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315350
55	NC_017023	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
56	NC_017023	TGG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315350
57	NC_017023	GA	3	6	2712	2717	50 %	0 %	50 %	0 %	383315350
58	NC_017023	GAA	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
59	NC_017023	GAA	2	6	2735	2740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
60	NC_017023	A	7	7	2756	2762	100 %	0 %	0 %	0 %	383315350
61	NC_017023	TTG	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315350
62	NC_017023	CAA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315350
63	NC_017023	TGAG	2	8	2914	2921	25 %	25 %	50 %	0 %	383315350
64	NC_017023	GAA	2	6	2979	2984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
65	NC_017023	AGA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315350
66	NC_017023	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	383315350
67	NC_017023	A	6	6	3353	3358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017023	T	6	6	3370	3375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017023	TTAGCG	2	12	3383	3394	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017023	GGT	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017023	A	7	7	3575	3581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017023	T	6	6	3601	3606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017023	T	6	6	3611	3616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017023	TATG	2	8	3663	3670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017023	GAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017023	A	9	9	3701	3709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017023	TTC	2	6	3719	3724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017023	A	7	7	3754	3760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017023	T	6	6	3786	3791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017023	T	6	6	3810	3815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.